按照西华大学《关于开展科研经费管理自查自纠工作的通知》（西华科字[2013]12号）文件要求，各课题组负责人对2011年以来学校承担的科研项目及其经费管理使用情况（包括：“十一五”期间立项但目前尚未结题的项目）进行了自查。在此基础上，审计处牵头，计划财务处、科技处等相关部门配合，对抽查的三十多个项目进行了重点检查。从检查的情况来看，主要存在以下几个方面的问题：
（1）由于我校科研经费管理文件历经多次修订，导致部分项目经费支出标准等出现前后不一致的现象；（2）部分项目存在无预算编制和预算批复的问题；（3）部分纵向项目的预算调整未严格按照有关规定办理手续；（4）由于我校还没有制定科研经费结账管理办法，因此部分项目存在结题却未结账的现象；（5）由于科研项目的开支范围与财务收支科目不能一一对应，导致部分项目支出统计的口径出现不一致的问题；（6）由于我校2011年开始实施的科研经费管理文件（西华行字[2011]32号文）中科技经费的开支范围含有接待费，因此部分项目有支出接待费的现象。
对以上这些问题的发现及整改，可以为学校以后的科研制度、科研管理、预算支出管理等方面起到很好的促进和监督作用。同时对审计的监督、咨询工作也起到了很大程度的推进作用。